Y Nữ Bóng Đêm là câu chuyện kể về nữ sinh viên y khoa Mary Mason, khi cô ngày càng trở nên thất vọng về thế giới giải phẫu cô từng ngưỡng mộ. Sự cám dỗ của đồng tiền khiến Mary bị cuốn vào thế giới ngầm của những ca phẫu thuật cho những "quái khách" sống trong bóng đêm.
Những ca phẫu thuật thành công của cô vang dội trong thế giới ngầm. Từ bọn mafia, vũ nữ, đạo chích, bọn giết người...đều tìm đến cô để được thay hình đổi dạng sau những phi vụ bất lương. Nhưng danh tiếng của cô đã kết thúc cuộc đời còn hơn cái gọi là quái khách.
