Võ Sĩ Đạo Cuối Cùng (The Last Samurai) lấy bối cảnh đất nước Nhật Bản loạn lạc vào năm 1876, sau khi cuộc duy tân Minh Trị diễn ra ở Nhật Bản. Thiên Hoàng lúc này còn non trẻ và bị thao túng, Nhật Bản mở cửa du nhập các văn hoá phương tây, chính điều đó làm xáo trộn đất nước và những nét văn hoá bản sắc của họ.
Vấn đề được nhắc đến trong phim là về mặt chính trị quân sự, người Nhật Bản từ trước đến nay vẫn tự hào vì sự bảo vệ của tinh thần thượng võ samurai, hiện tại chính quyền lại muốn cải cách quân đội trở nên hiện đại bằng súng ống, vũ khí hạng nặng như ở phương tây. Tom Cruise đóng vai chính là Alg Algren, một chiến binh của nội chiến Hoa Kì để làm cố vấn quân sự và huấn luyện cho Hoàng Đế Nhật Bản một đội quân hiện đại như mong muốn.
Nhiệm vụ của ông đồng thời cũng là quét sạch võ sĩ Samurai để không còn sự mâu thuẫn trong vấn đề quân sự nữa. Lúc này, thủ lĩnh còn lại của võ đạo Samurai là Katsumoto (Ken Watanabe), vẫn luôn cố gắng đấu tranh, bảo vệ văn hoá của Nhật Bản bằng một tinh thần tuyệt vời. Khi hai con người này gặp nhau, từ những kẻ thù địch giao chiến đẫm máu họ dần ngầm trở thành những người rất hiểu nhau. Thời gian sống cùng với tinh thần Samurai, Alg Algren có chuyển biến không còn là một chiến binh bị sang chấn tâm lý hậu chiến tranh nữa, ông được thứ văn hoá tuyệt vời đấy đả thông và cảm nhận được vì sao Katsumoto lại muốn gìn giữ nó đến vậy.