Thần Y Chính Truyện khắc họa cuộc đời của một ngự y - danh y lỗi lạc của đất nước Triều Tiên trong thế kỉ 16, 17. Ông là người có rất nhiều đóng góp to lớn cho sự nghiệp phát triển nền y học Triều Tiên. Đặc biệt ông còn là tác giả của một cuốn y thuật - tuy đã ra đời cách đây 400 năm; nhưng cuốn sách đã được UNESCO công nhận là di sản ký ức thế giới và là kim chỉ nam cho các thầy thuốc đông y Hàn Quốc.
Nội dung phim xoáy vào khoảng thời gian trước khi ông trở thành ngự y. Ông là con trai của quan tuần phủ tỉnh Yongcheon.
Trong một lần chứng kiến ngự y cứu sống người bệnh, ông đã quyết định trở thành lang trung để cứu giúp những người xung quanh. Với sự chỉ dẫn của vị ngự y già, ông đã học được rất nhiều kiến thức y khoa.
Đó là nền tảng kiến thức đã giúp cho ông rất nhiều trên con đường trở thành ngự y hoàng cung sau này.
