Người Ruồi 2 (The Fly 2) kể về Seth Brundle là một nhà khoa học nổi tiếng với những thí nghiệm bị biến dạng với dịch chuyển tức thời đã biến anh ta thành một con người lai / bay có tên là BrundleFly. Vài tháng sau khi loài côn trùng BrundleFly gặp sự tàn lụi của người yêu, Veronica, người bị bắn, cô chết trong khi sinh con trai của họ, Martin. Chủ nhân tham nhũng của Seth, Bartok, nhận nuôi Martin, chỉ để Martin có thể giải quyết các vấn đề mới mà TelePods vẫn hoạt động hiện tại và sử dụng anh ta làm dự án khoa học vì gen côn trùng không hoạt động. Martin giờ đã trưởng thành hoàn toàn, mặc dù anh mới 5 tuổi và gen ruồi bắt đầu thức tỉnh và khiến anh giống như người cha thân yêu, đã chết. Với sự giúp đỡ của bạn gái, Beth, họ đi đến bất cứ nơi nào họ có thể tìm ra cách chữa trị có thể trước khi Bartok tìm thấy chúng và mang chúng trở lại, nhưng không phải trước khi Martin kết thúc sự biến đổi thành MartinFly, loài BrundleFly nguy hiểm nhất.
