Đặc Công X Phần 1 kể về việc Phó Tổng thống mới được bầu Natalie Maccabee được bắt đầu vào một thế giới bí mật nguy hiểm bởi người quản lý giám đốc của mình, Malcolm Millar và Chánh án Caleb Thorne. Trái ngược với những gì công chúng tin rằng, công việc của Phó Chủ tịch là xa nghi lễ. Trong thực tế, được ghi nhận trong một phiên bản bí mật của Hiến pháp là một phần endowing Natalie với đại lý của riêng bí mật, John Case, được triển khai trong thời gian khủng hoảng. Natalie nhanh chóng thấy mình chơi trong khi con gái của giám đốc FBI Stanton bị bắt cóc, và chính quyền là bất lực trong việc giải cứu cô.
