Phim 12 Con Khỉ kể về James Cole là một tội hình sự sống dưới một hậu khải huyền Philadelphia vào năm 2035. Trong 1996-1997, bề mặt trái đất đã bị ô nhiễm bởi một loại virus chết người như vậy mà nó buộc những người sống sót để di chuyển dưới lòng đất. Trong những năm sau đó, các nhà khoa học đã thiết kế một hình thức không chính xác của thời gian đi lại . Xem Phim 12 Con Khi Để kiếm được một sự tha thứ, Cole cho phép các nhà khoa học để gửi cho anh ta vào nhiệm vụ nguy hiểm về quá khứ để thu thập thông tin về các vi rút, được cho là đã được phát hành bởi một tổ chức khủng bố được gọi là quân đội của Monkeys Mười Hai. Nếu có thể, ông là để có được một mẫu tinh khiết của virus gốc để chữa bệnh có thể được phát triển. Cole gặp rắc rối bởi những giấc mơ liên quan đến một cuộc rượt đuổi và bắn súng sân bay định kỳ.
Cole đến trong Baltimore vào năm 1990, không năm 1996 như kế hoạch. Ông bị bắt và phải nhập viện trong một bệnh viện tâm thần vào việc chẩn đoán của Tiến sĩ Kathryn Railly. Ở đó, ông gặp Jeffrey Goines, một bệnh nhân tâm thần đồng với cuồng tín quyền động vật và chống lợi người tiêu dùng khuynh hướng. Cole cố gắng không thành công để lại một thư thoại trên một số giám sát bởi các nhà khoa học trong tương lai. Phim Twelve Monkeys Sau một nỗ lực thoát, Cole đã bị khóa trong một tế bào, nhưng biến mất, trở về tương lai. Trở lại trong thời gian riêng của mình, Cole được phỏng vấn bởi các nhà khoa học, người chơi nhắn thư thoại méo mó mang đến cho các vị trí của quân đội của Monkeys Mười Hai và khẳng định rằng họ có trách nhiệm đối với virus. Ông cũng được hiển thị hình ảnh của rất nhiều người bị tình nghi là có liên quan, bao gồm cả Goines. Các nhà khoa học sau đó gửi Cole trở lại trong thời gian một lần nữa, lần đầu tiên để một rãnh Pháp trong Thế chiến thứ nhất , nơi Cole bắn vào chân trước khi vận chuyển thành công ông năm 1996.
