Sát Thủ Ninja kể về Casey Bowman từng là một đứa trẻ mồ côi sống lang thang ở đất nước Nhật Bản, anh được một võ đường cưu mang và nuôi nấng đến khôn lớn, sư phụ Takeda trong võ đường còn dạy võ cho anh rồi coi anh như con trai ruột của mình, do Casey luôn sống tốt và chăm chỉ rèn luyện võ nghệ nên anh được Namiko - con gái của sư phụ Takeda cũng như nhiều người khác yêu quý, chính điều đó đã khiến tên đại đồ đệ mưu mô, xảo quyệt Masazuka trong võ đường ngày càng căm ghét Casey. Trong một lần tập võ, Masazuka đã cố tình dùng kiếm thật giết Casey nhưng may mắn Casey đã chống trả lại, sư phụ Takeda thấy vậy liền đuổi Masazuka đi mặc dù ông cũng rất yêu thương và từng kỳ vọng hắn thành chiến binh Soke thực thụ...