Sau khi ổn định ở Green Hills, Sonic đã sẵn sàng để được tự do hơn, và Tom và Maddie đồng ý để anh ta ở nhà trong khi họ đi nghỉ. Nhưng, không bao lâu nữa họ đã biến mất, khi Tiến sĩ Robotnik trở lại, lần này cùng với một đối tác mới, Knuckles, để tìm kiếm một viên ngọc lục bảo có sức mạnh để xây dựng và phá hủy các nền văn minh. Sonic hợp tác với người bạn phụ của mình, Tails, và họ cùng nhau bắt đầu cuộc hành trình tìm kiếm viên ngọc lục bảo trước khi nó rơi vào tay kẻ xấu. Được đạo diễn bởi Jeff Fowler, và có sự tham gia của Jim Carrey, James Marsden và Ben Schwartz.
