Buddy Complex, câu chuyện xoay quanh Aoba Watase một chàng trai học sinh trung học trong tương lai sẽ là tướng lĩnh vĩ đại của loài người chống lại bọn xâm lược ngoài hành tinh. Nhận thấy tầm nghiêm trong nên bọn ngoài hành tinh đó đã liên tục phái những con robot trở về quá khứ để thủ tiêu Aoba Watase. Rất may mắn cho anh là một cô gái tương lai đã trở về nhanh chóng cùng con robot của mình để cứu Aoba Watase.
