Big Order kể về mười năm trước, một đứa trẻ muốn hủy diệt cả thế giới. Còn bây giờ, một nhóm người có khả năng ban điều ước của họ phụ thuộc vào sức mạnh của mình. Họ được gọi là Order User. Trước khi những người có sức mạnh Order, một người xuất sắc nhất với khả năng để cai trị và chinh phục thế giới và biến mọi người thành con rối khi nó trong lãnh thổ của mình. Sức mạnh này thuộc về Hoshimiya Eiji, người phải chịu trách nhiệm về các hiện tượng tiêu cực đã xảy ra chính xác mười năm trước đây.
